Der findes flere typer CO2 inkubatorer på markedet der hver har deres styrker og svagheder. Typisk står valget mellem vandkappe eller varmelegmer i inkubatorvæggen.
Varmelegmer giver mulighed for at lave sterilisationsprogrammer, og dermed effektiv rengøring - og varmelegmer er i dag gode til at lave hurtig tilbagevenden til den ønskede atmosfære.
En vandkappe er en "isolering" af vand der går hele vejen rundt om kammeret. Vandkappen giver en god temperaturhomogenitet i inkubatoeren - altså samme temperatur uanset hvor du måler i kammeret hvilket naturligvis er en fordel hvis du vil have ensartet vækst af dine celler uanset hvilken hylde du stiller cellerne på.
Recovery time
At vandkappemodeller i dag tilvælges af nogle skyldes recovery tiden - dvs. den tid fra man lukker lågen, til atmosfæren i kammeret er tilbage på setpunkt. Der går nemlig < 3 minutter. i en hvilken som helst anden type inkubator går der typisk >17 min. til man er tilbage på 95% af setpunkt - det kan være årsagen til at mange celler gror dårligt.
Renrums modeller
Ligeledes er de vigtigt at inkubatoreren er lavet i et stykke med rundede hjørner, for det gør rengøring nemmere og mere effektiv. De fleste inkubatorer er i dag derfor på hver deres måde "ren-rums" modeller - dvs. vækst ikke har flader, kanter, eller lign at vokse på.